Moteur d’optimisation des composés SeekR : mise en place d’heuristiques basées sur les données pour la prochaine génération de traitements thérapeutiques par ARNi extra hépatiques

Entité principale

Oligon Thérapeutiques inc.


Projet de 749 350 $ sur 1 an

  • Soutenu par le CQDM par l’entremise de :
    Ministère de l’Économie, de l’Innovation et de l’Énergie du Québec (MEIE)
  • Et un partenaire de cofinancement :
    – Oligon Thérapeutiques inc.

Le projet en détails :

Défi:

Bien que les conjugués GalNAc siRNA (ligands de petite molécule capables de reconnaître et de se lier à des récepteurs spécifiques des cellules hépatiques) aient révolutionné l’interférence ARN (RNAi) au niveau du foie, l’administration de siRNA à des tissus extra hépatiques demeure le principal goulot d’étranglement de l’industrie. Des approches émergentes, telles que les conjugués anticorps siRNA, présentent un potentiel prometteur, mais souffrent de contraintes importantes : complexité de fabrication biologique, faible pénétration des tumeurs solides et échappement endosomal inefficace. À ce jour, aucune plateforme mature ne combine la simplicité de fabrication de l’ARN synthétisé chimiquement avec la puissance de ciblage cellulaire des anticorps.

Solution:

La plateforme SeekR d’Oligon, une plateforme thérapeutique d’ARN entièrement synthétique et exclusive, vise à combler cette lacune. Une molécule SeekR est une chimère bivalente composée de deux aptamères à haute affinité encadrant un « pont » d’ARN double brin codant pour deux siRNA spécifiques. Il en résulte un médicament à base d’ARN auto administré capable de pénétrer des types cellulaires ciblés et de réduire précisément l’expression de multiples gènes, sans recours à des nanoparticules lipidiques ni à des vecteurs viraux.

Dans le cadre de ce projet, Oligon mettra en œuvre une approche systématique de plan d’expériences (Design of Experiments – DoE) afin de cartographier la relation multidimensionnelle entre l’architecture chimique et la performance fonctionnelle des composés thérapeutiques SeekR. Ces données seront intégrées dans des heuristiques d’optimisation SeekR (un ensemble exclusif de règles de conception algorithmiques). Ces heuristiques agiront comme un moteur prédictif permettant à Oligon de déterminer in silico l’architecture optimale de nouveaux candidats SeekR avant leur synthèse, transformant ainsi la découverte de médicaments d’un processus empirique en une discipline d’ingénierie évolutive.

Réalisations prévues/Retombées:

En établissant avec succès ces heuristiques d’optimisation, Oligon maximisera non seulement les probabilités de succès clinique de ses actifs principaux, mais accélérera également l’efficacité et le succès de la transposition de nouveaux concepts de ciblage multiple en médicaments SeekR pharmacologiquement optimisés. De plus, le cadre de conception algorithmique développé dans ce projet permettra directement la conception de combinaisons aptamère siRNA de type SeekR, générant ainsi un actif d’innovation réutilisable et évolutif qui renforcera la compétitivité commerciale d’Oligon et contribuera à catalyser la croissance de l’écosystème québécois émergent en thérapies à base d’ARN.

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