Une plateforme protéogénomique pour la priorisation des cibles thérapeutiques ARN basée sur l’information génétique

Entité principale :

5 Prime Sciences Inc


Projet de 999 984 $ sur 18 mois

  • Soutenu par le CQDM par l’entremise de :
    Ministère du Développement économique, de l’Innovation et de l’Énergie (MDEIE)
  • Et d’un partenaire de cofinancement :
    – 5 Prime Sciences Inc.

Le projet en détails :

Défi :

Les thérapies fondées sur l’ARN, dont les petits ARN interférents (siRNA) et les oligonucléotides antisens (ASO), transforment le développement de médicaments en permettant une inhibition durable et ciblée aux tissus, des gènes impliqués dans les maladies. Toutefois, l’identification de cibles biologiques appropriées, qui contribuent causalement aux maladies humaines et qui sont exploitables par les modalités thérapeutiques fondées sur l’ARN, demeure un obstacle majeur. Les approches actuelles de découverte de cibles tiennent rarement compte des exigences propres à l’ARN, comme l’expression spécifique aux tissus, le saut d’exon ou la direction de l’effet nécessitant une inhibition. Par conséquent, le domaine manque de plateformes computationnelles évolutives intégrant systématiquement les données génétiques humaines afin de prioriser les cibles thérapeutiques fondées sur l’ARN, ce qui entraîne des investissements en R-D inefficaces et retarde l’accès des patients à des médicaments efficaces.

Solution :

LOFTier est une plateforme protéogénomique de priorisation des cibles développée par Sciences 5 Prime afin d’identifier les gènes responsables de maladies qui se prêtent aux thérapies ARN. Elle intègre des bases de données à grande échelle portant sur la génomique, la protéomique, l’expression, l’épissage, les variants de perte de fonction et des bases de données cliniques, afin d’identifier les gènes qui contribuent causalement aux maladies et de générer des classements de cibles pondérés par les données probantes à l’aide de méthodes d’apprentissage automatique entraînées et validées sur de vastes ensembles de données humaines. Dans le cadre de ce projet, LOFTier sera appliquée et validée afin de prioriser les cibles pour la conception de médicaments siRNA et ASO dans plusieurs champs thérapeutiques à fort fardeau, notamment les maladies métaboliques du foie (MASLD/NASH), la neurodégénérescence, l’insuffisance rénale chronique et les maladies inflammatoires. Son approche à haut débit et multi-indications vise à améliorer la sélection des cibles.

Réalisations prévues/Retombées :

LOFTier devrait améliorer la sélection des cibles thérapeutiques fondées sur l’ARN en intégrant les données génétiques humaines, protéogénomiques et d’expression dans un cadre de priorisation propre à l’ARN. La plateforme devrait contribuer à identifier des cibles davantage liées causalement à la maladie, plus spécifiques aux tissus et mieux adaptées aux approches par siRNA, ASO ou saut d’exon. En permettant une priorisation évolutive des cibles dans plusieurs domaines thérapeutiques à fort fardeau, LOFTier pourrait réduire les investissements inefficaces en R-D, soutenir une meilleure prise de décision aux premières étapes et diminuer le risque d’échecs coûteux aux stades avancés du développement de médicaments fondés sur l’ARN. Elle pourrait également renforcer le positionnement commercial de 5Prime Sciences en appuyant des partenariats avec des sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques actives dans les thérapies fondées sur l’ARN. Ce projet est important pour le Québec, car il soutient la croissance d’une entreprise locale des sciences de la vie dans un domaine stratégique et en forte expansion, tout en renforçant l’expertise de la province en génomique, en biologie computationnelle et en innovation thérapeutique fondée sur l’ARN.

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