Appel à idées : Conception de protéines assistée par l’IA
Le CQDM est heureux de lancer un appel à idées pour notre prochain CQDM Connect-Pharma : Journée de Pitch.
Nous sommes en quête de travaux de recherche de classe mondiale sur la conception de protéines assistée par l’IA à présenter à des experts du domaine issus des principales organisations pharmaceutiques mondiales le 5 mars 2025.
Notre objectif est d’apporter la recherche canadienne avant-gardiste et innovante aux membres pharmaceutiques du CQDM et de faciliter les interactions entre nos membres et l’écosystème canadien. Les projets collaboratifs développés avec un membre pharmaceutique du CQDM sont admissibles à l’obtention d’un financement via le programme Quantum Leap du CQDM.
Nous invitons les chercheurs canadiens passionnés et les équipes visionnaires à soumettre des idées novatrices susceptibles de transformer le paysage médical et d’améliorer les résultats pour les patients.
Portée et objectifs :
***Cet appel concerne la conception de protéines assistée par l’IA et, à ce titre, les soumissions spécifiques à l’IA pour la conception de petites molécules, l’optimisation, etc. sont hors focus.
- Optimisation de protéines thérapeutiques : Projets visant à optimiser les protéines thérapeutiques en vue d’une efficacité accrue, d’une immunogénicité réduite et d’une meilleure stabilité.
- Optimisation des antigènes : Projets visant à optimiser les antigènes pour accroître l’efficacité des vaccins, refléter la structure Ag appropriée, augmenter l’immunogénicité et améliorer la stabilité.
- Conception de protéines de novo : Création par l’IA de protéines entièrement nouvelles dotées de fonctions thérapeutiques spécifiques.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à la biocatalyse.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à la biocatalyse.
- IA pour l’ingénierie des anticorps : Projets axés sur les méthodes d’IA pour la conception d’anticorps monoclonaux, d’anticorps bispécifiques ou d’anticorps à domaine unique (sdAb) présentant une affinité et une spécificité de liaison améliorées.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à l’optimisation multiparamétrique des anticorps et à la conception d’anticorps de novo.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à l’optimisation multiparamétrique des anticorps et à la conception d’anticorps de novo.
- Thérapies enzymatiques : Conception d’enzymes pour les troubles métaboliques, les maladies rares ou comme outils de synthèse de médicaments.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à l’optimisation de la fonction catalytique et à la prédiction de la spécificité du substrat (prédiction du potentiel de substrat pour une paire de séquences molécule/protéine donnée).
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à l’optimisation de la fonction catalytique et à la prédiction de la spécificité du substrat (prédiction du potentiel de substrat pour une paire de séquences molécule/protéine donnée).
- Algorithmes innovants : Projets proposant de nouvelles méthodes d’IA pour la prédiction de la structure des protéines, l’amélioration de la stabilité ou l’optimisation fonctionnelle.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à la prédiction des interactions protéine-protéine et à la prédiction de la fonction des protéines (cette dernière étant principalement inspirée par la catalyse).
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure des idées liées à la prédiction des interactions protéine-protéine et à la prédiction de la fonction des protéines (cette dernière étant principalement inspirée par la catalyse).
- Approches multimodales de l’IA : Intégration de l’IA à d’autres outils informatiques tels que la dynamique moléculaire ou la chimie quantique pour améliorer la conception des protéines.
- Approches de vaccinologie inversée : Projets basés sur les séquences d’anticorps ou de TCR de convalescents ou de sujets protégés atteints de maladies infectieuses, afin de concevoir de meilleurs antigènes vaccinaux.
Focus technique et méthodologique :
- Perspectives basées sur les données : Utilisation d’ensembles de données de haute qualité (par exemple, données sur les interactions protéine-protéine, bases de données structurelles, données biocatalytiques) pour former des modèles d’IA.
- Intégration de l’IA dans les flux de travail expérimentaux : Propositions combinant des prédictions computationnelles avec une validation expérimentale (par exemple, criblage à haut débit ou techniques de biologie structurale).
- Amélioration des modèles prédictifs : Développement d’outils d’IA pour prédire les interactions entre protéines et petites molécules, les affinités de liaison ou les fenêtres thérapeutiques.
- Automatisation de la conception des protéines : L’IA pour rationaliser les processus de conception itératifs, tels que l’évolution dirigée ou l’ingénierie rationnelle.
- IA explicable : accent mis sur l’interprétabilité pour comprendre la base moléculaire des protéines conçues.
Industrie et impact thérapeutique :
- Aires thérapeutiques : Projets portant sur des maladies hautement prioritaires telles que le cancer, les maladies auto-immunes, les maladies infectieuses ou les maladies neurodégénératives.
- Développement plus rapide des médicaments : Outils d’IA pour réduire les délais de développement préclinique.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure
- l’amélioration de l’efficacité de l’ingénierie des protéines.
- la réduction du nombre de cycles itératifs d’ingénierie des protéines/d’évolution dirigée.
- Les capacités spécifiques d’intérêt pourraient inclure
- Réduction des coûts : Solutions permettant de réduire les coûts associés à la découverte et au développement de médicaments, en particulier pour les produits biologiques.
Processus :
Tous les projets soumis seront partagés avec les membres pharmaceutiques du CQDM pour examen et classement. Les projets les mieux classés seront sélectionnés pour être présentés aux membres pharmaceutiques mondiaux du CQDM lors d’un CQDM Connect-Pharma: Journée Pitch Day, le 5 mars 2025.
Qui peut postuler :
Les institutions académiques canadiennes, les entreprises de biotechnologie et les organismes de recherche peuvent postuler. Les projets de collaboration qui impliquent des partenariats entre le monde universitaire et l’industrie sont également encouragés. Nous accueillons des équipes multidisciplinaires qui peuvent apporter une expertise diversifiée à la table.
Date limite et soumission : la date limite de soumission est le 5 février 2025. Veuillez soumettre à [email protected]. Les lignes directrices et instructions détaillées pour la soumission des propositions et le formulaire de sélection sont disponibles ici, via le formulaire d’application (en anglais vu le caractère international).
Pour plus d’informations, veuillez contacter :
Simon Fournier, CQDM : [email protected]
